MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 5522

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014002	AGC	2	6	564346	564351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_014002	TGCC	2	8	564579	564586	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_014002	AAG	2	6	564721	564726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_014002	CGG	2	6	564737	564742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_014002	GTA	2	6	564770	564775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_014002	GTAG	2	8	564952	564959	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_014002	CAA	2	6	564996	565001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_014002	AGG	2	6	565043	565048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_014002	GC	3	6	565105	565110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_014002	CTG	2	6	565138	565143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_014002	TAGCA	2	10	565179	565188	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1512	NC_014002	GCA	2	6	565356	565361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_014002	GTT	2	6	565377	565382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_014002	CGT	2	6	565418	565423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_014002	CTA	2	6	565443	565448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_014002	AGC	2	6	565544	565549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_014002	TAA	2	6	565694	565699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_014002	TCA	2	6	565902	565907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_014002	AGA	2	6	565977	565982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_014002	GCT	2	6	566042	566047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_014002	AC	3	6	566081	566086	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_014002	T	6	6	566087	566092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_014002	ATT	2	6	566108	566113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_014002	ATT	2	6	566241	566246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_014002	TGG	2	6	566321	566326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_014002	A	7	7	566398	566404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_014002	ATT	2	6	566818	566823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_014002	T	6	6	566835	566840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_014002	TTC	2	6	566977	566982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_014002	ATT	2	6	567056	567061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_014002	ATT	2	6	567068	567073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_014002	AT	4	8	567085	567092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_014002	TTA	2	6	567129	567134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_014002	AT	4	8	567156	567163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_014002	AGA	2	6	567164	567169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_014002	TA	3	6	567210	567215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_014002	T	6	6	567251	567256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_014002	CAT	2	6	567279	567284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_014002	ATT	2	6	567307	567312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_014002	T	6	6	567320	567325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_014002	AGA	2	6	570020	570025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_014002	AAG	2	6	570041	570046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_014002	AG	3	6	570185	570190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_014002	AATG	2	8	570230	570237	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_014002	GTG	2	6	570241	570246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_014002	TAA	2	6	570262	570267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_014002	A	7	7	570277	570283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_014002	T	7	7	570287	570293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_014002	TA	3	6	570303	570308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_014002	AGC	2	6	570317	570322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_014002	CTG	2	6	570348	570353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_014002	AT	3	6	570367	570372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_014002	GCA	2	6	570398	570403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_014002	CGT	2	6	570406	570411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_014002	AAT	2	6	570429	570434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_014002	CCG	2	6	570439	570444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_014002	GGA	2	6	570473	570478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_014002	GGA	2	6	570519	570524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_014002	TCCTTC	2	12	570545	570556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_014002	TCT	2	6	570565	570570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_014002	GAT	2	6	570614	570619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_014002	ATC	2	6	570661	570666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_014002	CAA	2	6	570817	570822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_014002	AGA	2	6	570953	570958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_014002	T	6	6	570965	570970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_014002	GGA	2	6	571020	571025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_014002	GAAT	2	8	571037	571044	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_014002	CTT	2	6	571240	571245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_014002	GAT	2	6	571269	571274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_014002	ATG	2	6	571441	571446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_014002	T	6	6	571460	571465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_014002	A	7	7	571505	571511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_014002	TGG	2	6	571631	571636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_014002	A	6	6	571729	571734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_014002	ATG	2	6	571749	571754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_014002	TGT	2	6	571757	571762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_014002	AAG	2	6	571864	571869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_014002	CTC	2	6	571909	571914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_014002	TGT	2	6	571945	571950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_014002	TTA	2	6	572938	572943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_014002	TA	3	6	572972	572977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_014002	AAC	2	6	572987	572992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_014002	AT	3	6	573037	573042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_014002	AAT	2	6	573048	573053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_014002	TAT	2	6	573057	573062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_014002	GTTAT	2	10	577699	577708	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_014002	TA	3	6	577734	577739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_014002	TA	3	6	577751	577756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_014002	TAAA	2	8	577785	577792	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_014002	TCT	2	6	577836	577841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_014002	GGTG	2	8	577874	577881	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_014002	T	6	6	577902	577907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_014002	GGA	2	6	577920	577925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_014002	AGG	2	6	578454	578459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_014002	CTTT	2	8	579944	579951	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1596	NC_014002	ATTG	2	8	582990	582997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_014002	GGA	2	6	583030	583035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_014002	ATT	3	9	583496	583504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_014002	AAT	2	6	583520	583525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_014002	GAG	2	6	583534	583539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_014002	TAT	2	6	587133	587138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_014002	ATC	2	6	587189	587194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_014002	TAT	2	6	587245	587250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_014002	AATA	2	8	587271	587278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_014002	CTT	2	6	588232	588237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_014002	GTT	2	6	589590	589595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_014002	AAAAG	2	10	589635	589644	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_014002	AT	3	6	589645	589650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_014002	ACC	2	6	590203	590208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_014002	TTG	2	6	590275	590280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_014002	ACC	2	6	590282	590287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_014002	TATT	2	8	590315	590322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_014002	ATTTT	2	10	590387	590396	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_014002	ATT	2	6	590403	590408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_014002	CCT	2	6	594945	594950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1616	NC_014002	TGG	2	6	595012	595017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_014002	AGA	2	6	595825	595830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_014002	GTT	2	6	595850	595855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_014002	T	6	6	595854	595859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_014002	AT	3	6	595890	595895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_014002	TTC	2	6	595914	595919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_014002	T	6	6	595931	595936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_014002	TTAT	2	8	595990	595997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_014002	T	8	8	596034	596041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_014002	TATATT	2	12	596063	596074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_014002	AGG	2	6	596116	596121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_014002	CTTT	2	8	598139	598146	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1628	NC_014002	TAAA	2	8	598162	598169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_014002	ATG	2	6	598189	598194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_014002	CTTT	2	8	599170	599177	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_014002	T	6	6	599175	599180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_014002	ATA	2	6	599210	599215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_014002	ATG	2	6	599220	599225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_014002	GTT	2	6	600801	600806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_014002	AT	3	6	600807	600812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_014002	ATTC	2	8	604539	604546	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1915	NC_014002	GTA	2	6	699333	699338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1916	NC_014002	GTAG	2	8	699515	699522	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1917	NC_014002	CAA	2	6	699559	699564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1918	NC_014002	AGG	2	6	699606	699611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1919	NC_014002	GC	3	6	699668	699673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1920	NC_014002	CTG	2	6	699701	699706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1922	NC_014002	GCA	2	6	699919	699924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1924	NC_014002	CGT	2	6	699981	699986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1928	NC_014002	TCA	2	6	700465	700470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1930	NC_014002	GCT	2	6	700605	700610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1932	NC_014002	ATT	2	6	700671	700676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1933	NC_014002	ATG	2	6	700737	700742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1935	NC_014002	TGAA	2	8	700764	700771	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1945	NC_014002	ATA	2	6	707817	707822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1946	NC_014002	ATT	2	6	707851	707856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1947	NC_014002	CTTT	2	8	708699	708706	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1948	NC_014002	TTC	2	6	711341	711346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1950	NC_014002	ATT	2	6	713670	713675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1951	NC_014002	ATA	2	6	713679	713684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1953	NC_014002	TGA	2	6	713697	713702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1959	NC_014002	TGTGA	2	10	714181	714190	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1963	NC_014002	AAC	2	6	718910	718915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1975	NC_014002	T	6	6	720517	720522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1976	NC_014002	T	6	6	720543	720548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1977	NC_014002	ATA	2	6	721041	721046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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